石林溶洞虽多，然游人最多，最早被人们发现的，要数芝云洞。洞在李子箐石林北面约15公里处。康熙《澄江府志》、（路南州志）都有记载：“芝云洞，碉门石似芝与云，故名。芝云初入，磅礴空敞，可容千人；再入葫芦口内更宽广。四壁乳窟，击之有钟鼓声。又有石抨、石床、石田、石浪，奇怪不可名状。古号仙迹。”前人金成宪曾有《石洞仙踪》诗云：

神仙何代炼丹修，云锁千年洞壑幽。

路绕毒苔深可到，窟含森邃渺难求。

床前冠履于今在，案上棋抨自昔留。

服气想应长辟谷，石田何事役耕牛。

溶洞虽号“仙踪”，但凡人亦可寻迹。带着汽灯、手电进入洞内，迂回蛇行，不久，即见一厅豁然开朗，石钟乳、石笋、石柱玲球剔透，斗者争胜。光照壁影，如月穿晓岩，溪云接水，壁气侵寒，石光滴翠，清幽可爱。复前行，洞口狭窄，仅能通人，不一会，又有一个宏敞的大厅呈现在人们的面前。厅内怪石奇峰，各呈奇观。站立者，或如白发老翁，扶杖而立；或为银河飞瀑，倒挂水帘；或如玉树盘空，根深叶茂。地下者，有石如青蛙蹲伏，跃然欲前，有一片石景宛如群龙行空，穿云吐雾，冉冉往前。顶上者，呼之日“观音上坐”，亦颇恰切。更妙的是这些石钟乳击之有声，有的清脆悦耳，有的洪亮悠远，有的雄浑辽阔，如能仔细区分，妥加利用，说不定还会成为一个奇妙的音乐厅呢！大厅左右还有许多小洞，高低宽窄，各有特点，洞套洞，洞连洞，似断实连，丰富，奇巧，令人叫绝。前人曾作诗描绘这里的景色：

曲折层深出化工，看来窟窦尽玲珑。

参看乳笋排行立，壮丽亭台隔丈逢。

四座芝横思戏彩，千堆云霭忆探穷。

游人眷恋忘归去，知与蓬莱仿佛同。

——徐致心《芝云硐》

通过大厅再往前进，洞逐渐窄小，忽有一穴透光，如矩形窗户。至则为洞口，遥望群山，一片葱绿，倍加可爱，阳光也分外明媚。

小芝云洞，在大芝云洞北侧。洞门极狭，仅能容一人。稍进即阔，凉气宜人。水湿苔滑，道路难行，游人较少。洞内石菌、石花、石山俯拾即是。

芝云洞与杭州的“烟霞三洞”、桂林的七星岩相比，景色之奇丽有过之而无不及。这样美不胜收的地下宫殿，至今未能很好开发利用，不少游人去石林而未能领略芝云洞奇景，实为撼事。