建于1938年,以澳门主要教堂的巴罗克式为主。圣堂外墙以奶白色为主,还有椭圆形的窗户及钟楼。

在圣堂的前面还1910年战胜海盗的纪念碑,而且在教堂内仍然存放著一些亚洲最神圣的遗物,在一个银制圣骨匣里存放著圣方济各的臂骨,圣人在日本传教後,打算进入中国,他在1552年在距离澳门70公里的上川岛逝世。

教徒在日本被迫害期间,26名天主教外籍及日藉神父于1597年在长崎被钉十字架殉道。而数以百计的日本教徒在1637年SHIMABARA革命中被杀害, 还有一些殉教者的骸骨被带往澳门存放在圣保禄教堂,但因一次大火将整座圣保禄大教堂焚毁,所以,这批骸骨就转送大堂存放,直至1974年,再迁移到圣方济各圣堂安放。